Дак для FDT только один вариант бута, тот что внутренний. И при его запуске на SH70xx происходит стирание содержимого user флеша. Что на 72ххх происходит - не знаю.
USER BOOT не катит, потому что - во первых не известно что там и используется ли он (можно понять с чего стартует - посмотрев дефотные состояния ног MDx проца), во вторых, если используется - неизвестен протокол работы с этим всем.
У хонды например он вообще не используется. Сразу стартует основная user area.
Судя по всему - либо проц в бут не перешёл, либо неправильно терминал распаян.
Для перевода проца в бут надо +5В подать на FWE и MD1.
В FDT просто как Generic BOOT Device ставь и он сам дальше разберётся.